Miejski Klub Sportowy Czarni odgrywa ważną rolę w życiu społecznym Węgrowa. Jest najdłużej funkcjonującym klubem w historii miasta. Kontynuując tradycje założonego jesienią 1944 roku Klubu Sportowego Arsenał, istnieje ponad 70 lat.
Dzieje MKS Czarni są jednak tak zawiłe, że nie sposób opisać jego działalności bez konieczności przedstawienia w ogóle historii sportu, i szerzej ujmują historii kultury fizycznej w Węgrowie. Niezbędne jest przypomnienie funkcjonujących w przeszłości na terenie miasta organów administracji państwowej i samorządowej zarządzających kulturą fizyczną oraz innych klubów sportowych i organizacji kultury fizycznej. Dość powiedzieć, klub sportowy o nazwie Czarni trzy razy upadał , ale po kilku latach znowu wznawiał działalność. Istniał w latach 1947-1949, 1957-1963, 1968-1983 i od roku 1986. Natomiast, jeśli przerywał lub zawieszał działalność, sekcje w całości lub w części przechodziły do innych węgrowskich klubów i stowarzyszeń sportowych, ale zdarzało się i tak, że po latach niektóre wracały do macierzy.
Klubami i stowarzyszeniami, których sekcje MKS Czarni przejmował lub one przejmowały zawodników i trenerów, były: KS Arsenał, KS Gwardia, KS Sparta, Klub Inteligencji Pracującej, Rada Powiatowa Zrzeszenia LZS, LZS Węgrów, Ognisko TKKF Węgrowianka, KS Start, KS Pogoń, Młodzieżowy Ośrodek Tenisa Stołowego, RKS ZWUT, Ognisko TKKF Łącznościowiec, LZS Starawieś, Międzyszkolny Klub Sportowy NIKE, Ośrodek Sportu i Rekreacji, Ognisko TKKF Promyk, Węgrowski Klub Sportowy Sfinks, Uczniowski Klub Sportowy 1 Węgrów, Uczniowski Klub Sportowy Niedźwiadek, Węgrowskie Towarzystwo Piłki Siatkowej Czarni-Nike, Uczniowski Ludowy Klub Sportowy Tenis, Stowarzyszenie Rozwoju Sportu Dzieci i Młodzieży.
1944 – Arsenał Węgrów
1947 – KS OM TUR Czarni Węgrów
1948 – Szkolne Koło Sportowe Węgrów
1950 – Koło Sportowe Gwardia Węgrów
1956 – LZS PZGS Węgrów
1956 – Koło Sportowe Sparta Węgrów
1957 – LKS Czarni Węgrów
1958 – Klub Inteligencji Pracującej
1959 – TKKF Węgrowianka
1962 – Koło Sportowe Start Węgrów
1963 – LZS Węgrów
1963 – KS Pogoń Węgrów
1966 – LZS POM Węgrów
1968 – LKS Czarni Węgrów
1973 – MOTS Węgrów
1973 – RKS ZWUT Węgrów
1975 – Ośrodek Sportu i Rekreacji
1975 – Środowiskowe Ognisko TKKF Promyk
1977 – Ognisko TKKF Łącznościowiec
1981 – LZS Starawieś
1983 – MKS Nike Węgrów
1986 – MLKS Czarni Węgrów
1992 – MKS Czarni Węgrów
1994 – Węgrowski Klub Sportowy Sfinks
1994 - UKS Niedźwiadek Węgrów
1997 – UKS 1 Węgrów
1999 – ULKS Tenis Węgrów
2005 – WTPS Czarni-Nike Węgrów
2005 – Piłkarski MKS Czarni
2007 – SPS Olimpia Węgrów
21 stycznia 2006 roku odbyło się Wale Zebranie Członków MKS Czarni, na którym wybrano zarząd w składzie : prezes – Paweł Marchela, dyrektor ds. organizacyjnych – Dariusz Dobosz, dyrektor ds. sportowych Mariusz Witkowski, członkowie zarządu – Henryk Giers i Tomasz Wrzosek. Do Komisji Rewizyjnej weszli : Rajmund Staręga i Bogdan Kosiorek.
Kadencja nowych władz miała trwać dwa lata zgodnie ze statutem. Jednak Paweł Marchela pełnił funkcję prezesa niespełna trzy miesiące, bowiem już w marcu, tuż przed inauguracja wiosennej rundy piłkarskiej, złożył rezygnację. Wtedy członkowie zarządu wybrali na stanowisko pełniącego obowiązki Prezesa – Dariusza Dobosz. Dariusz Dobosz jest Prezesem Klubu do dnia dzisiejszego.
Obecny herb klubu powstał w roku 2003
i jest autorstwa Andrzeja Laskowskiego.